Vous commencez votre aventure par une mission d'assassinat. Puisque vous êtes un ninja, donc un guerrier de l'ombre, vous devez rester furtif. Avancez donc à gauche dans l'ombre et suivez les consignes qui s'affichent sur l'écran. Une fois derrière le garde, exécutez-le en suivant les commandes indiquées.

Entrez ensuite par le portail et faufilez-vous dans la broussaille. Avancez vers le prochain garde et attaquez-le par derrière. Collez-vous ensuite au mur gauche toujours dans l'ombre et avancez lentement. Ne courez pas pour ne pas alerter le garde. Exécutez-le et avancez puis passez entre les deux torches qui vous indiquent le chemin.

Avancez ensuite et approchez-vous de la lanterne pour l'éteindre en soufflant dessus. Passez ensuite à la deuxième lanterne. Approchez-vous du mur du fond et portez la caisse. Placez-la contre le mur et accrochez-vous à la corniche. Sautez de l'autre coté et avancez le long du mur de droite. Ramassez l'objet qui se trouve derrière la jarre, remplissez-le d'eau et visez la première torche. Avancez ensuite dans l'herbe (à droite) et exécutez le garde en silence. Aspergez ensuite la deuxième torche et entrez par la porte.

Avancez vers la caisse et montez dessus. Sautez pour atteindre la poutre et marchez dessus jusqu'à la zone où se trouve le garde (sous vos pieds). Exécutez-le furtivement sans descendre et déclencher l'alerte. Descendez ensuite et sortez par la porte.

Vous vous retrouverez dans le jardin. Utilisez l'oeil de l'esprit pour repérer votre chemin. Allez ensuite derrière le premier garde et éliminez-le. Vous pouvez éteindre la lanterne qui se trouve à gauche. Avancez ensuite dans l'herbe de droite. Eteignez la torche et allez devant le petit bassin. Descendez dans l'eau et nagez vers la rive gauche. Approchez-vous du garde, tirez-le par derrière et noyez-le sans faire de bruit. Montez ensuite et entrez par la porte de gauche.

Avancez vers le shuriken qui se trouve par terre, à gauche, et prenez-le. Visez le garde qui se trouve au fond et lancez votre projectile pour le pousser dans le puits. Il faut être à une bonne distance de votre ennemi, ni trop loin pour rater votre cible et ni trop près pour être découvert. Avancez ensuite vers le puits et prenez le ninjato qui se trouve à sa droite. Utilisez cette nouvelle arme pour détruire le cadenas de la porte située à gauche. Entrez et ramassez les shurikens qui sont par terre.

Allez dans le couloir gauche et longez le mur droit. Utilisez un shuriken pour éteindre la bougie et avancez lentement puis entrez dans la chambre de droite. Allez vers la porte d'en face. Collez-vous au mur et attendez que les gardes détournent le regard pour aller vous placer dans l'ombre. Restez ensuite collé au mur et allez vers la porte avec la torche bleue.

Dans le prochain couloir, commencez par éteindre la première bougie. Montez ensuite sur les étagères de droite et avancez. Eliminez le garde en chemin et descendez devant la porte. Sortez et avancez dans l'herbe (à droite) pour éliminer un autre garde. Si vous le souhaitez, entrez par la deuxième porte, à gauche, et exécutez un nouveau garde. Ressortez et allez à la dernière porte de droite. Avancez et éteignez la bougie qui se trouve près du garde ensuite éliminez ce dernier. Entrez dans la chambre de droite et avancez vers la porte de gauche. Eliminez le samouraï et allez vers la sortie.

Avancez ensuite dans l'herbe jusqu'au garde qui dort. Faites en sorte que son sommeil soit éternel et avancez. Entrez par la porte de la cuisine et attendez que la servante se ramène pour la contourner et avancer dans le couloir. Ramassez les shurikens et accrochez-vous au rebord avant de tourner dans le couloir. Avancez vers le centre de la pièce et, sans perdre de temps à tuer les gardes, allez vers le marchand cruel et exécutez-le sans bruit.