Geo se réveille et Mega a disparu. Lorsque le bip se fera entendre, lisez votre mail au sujet de l'ouverture du magasin et allez ouvrir votre porte. Un policier débarque et vous explique qu'il enquête sur les derniers événements survenus. Une fois qu'il est parti, sortez de chez vous pour rejoindre le Point Vista et y faire une rencontre. Vous retrouverez ensuite Mega et devrez rentrer chez vous suite à la conversation. Sur la route du retour, une nouvelle séquence aura lieu et à la fin de celle-ci, Mega vous mettra en tête de rentrer dans le Transer de Copper.
Rendez-vous donc au niveau du magasin " GDVague " (à visiter au préalable dans le monde réel si vous le souhaitez) après avoir enfilé vos lunettes, afin d'effectuer un " pulse-in " au niveau du Wavehole habituel. Une fois sur les ondes, contournez le magasin pour vous approcher du Wavehole de Copper, mais il vous sera impossible de rentrer à l'intérieur. Effectuez un " pulse out ", puis rendez-vous aux escaliers du Point Vista, pour aller observer un petit robot bleu sur la droite. Vous ne pouvez pas l'utiliser, mais vous pouvez aller demander à Joe qu'il vous l'active. Il se trouve en face du magasin " GDVague ". Parlez-lui, mais il ne voudra pas vous aider. Effectuez alors un " pulse-in " pour pénétrer dans son Transer. Lisez son message, pour apprendre qu'il a caché la carte Pitcher-Man sous un banc. Reste à savoir lequel. Il s'agit du banc rouge (sous forme de 3 carrés rouges) qui se trouve au Point Vista. Observez-le pour trouver la carte, puis allez de nouveau observer le robot bleu.
Mettez les lunettes et effectuez un " pulse-in " au niveau du Wavehole situé un peu plus haut, afin d'aller pénétrer dans l'espace ordi de ce robot. Vous trouverez 10 HP supplémentaires pour votre réserve maximum au bas de la carte, tandis qu'il vous faudra parler à cette machine en forme de balle de base-ball située au centre. Eliminez ses virus, puis une séquence va suivre, dans laquelle Mega va attirer Copper vers la machine. Lorsque cela vous est demandé, pointez sur l'écran pour lui lancer une balle en pleine face. Effectuez alors un " pulse-in " au niveau du Wavehole du coin après avoir enfilé vos lunettes, puis dirigez-vous vers Copper, afin de pénétrer dans son Transer et y lire le message. Suite à ceci, Mega va effacer toutes les données et Copper va se réveiller et partir. Retournez donc chez vous faire un gros dodo...
Vous vous réveillez et devez à nouveau aller ouvrir votre porte. Suite à la discussion, sortez de chez vous et rendez-vous au Point Vista après avoir reçu un signal. Observez le train et vous parlerez à Sonia. Vous devrez l'aider à se cacher. Une fois que Zack est parti, vous reprenez le contrôle de Geo. Allez parler à Aaron dans son labo à AMAKEN, puis suite à la conversation et à l'apparition des ondes Z, rendez-vous au musée pour aller effectuer un " pulse-in " au niveau du Wavehole de la fusée. Dirigez-vous vers le haut pour aller trouver une première boule et l'éliminer, puis allez jeter un oeil dans le SimEspace (en passant par le bas et en remontant) pour y trouver une autre boule à combattre. Une fois ceci fait, revenez au musée, puis dirigez-vous vers le bas, vers les foyers AMAKEN. Si vous aviez parlé au garçon en rouge dans le magasin " GDVague ", vous vous souvenez sûrement du défi qu'il vous avait lancé. Il se trouvera alors non loin de là, et vous attendra comme promis. Il a la forme d'un crabe rouge et vous pourrez engager un combat dès maintenant si vous le souhaitez.
Si vous décidez de le combattre, sachez qu'il dispose de trois attaques distinctes. Il commencera par vous envoyer des bulles qui se parent facilement avec Y, puis une grande vague dont vous pourrez vous protéger de la même manière, ou bien il pourra également envoyer ses pinces, mais votre bouclier sera cette fois inefficace. Vous ne pourrez alors qu'esquiver sur les côtés. Pas de panique, vous aurez la possibilité de le combattre autant de fois que vous le souhaitez... Vous gagnerez sa carte et ainsi le pouvoir d'invoquer cette vague par la suite.
En repartant par ce chemin qui fait face au crabe, prenez la deuxième sur votre gauche pour rejoindre une nouvelle boule à affronter, tandis que vous trouverez un vendeur en prenant la troisième à droite. Après avoir détruit la boule, poursuivez jusqu'au secteur du labo. Empruntez le chemin droit pour aller détruire une nouvelle boule, revenez sur vos pas et partez cette fois vers la gauche, jusqu'à atteindre un téléporteur bleu. Celui-ci va vous mener à la dernière boule vers la gauche, après avoir contourné par la droite. Attention de ne pas descendre tout à fait en bas pour récupérer l'onde mystère verte que vous apercevez, à moins que vous ne souhaitiez vous frotter à un Cygnus Wing de retour, rôdant dans les parages avec pas moins de 1000 HP.
{{uppage}}Si vous le battez, vous gagnerez sa carte.
Effectuez un " pulse-out " une fois toutes les boules détruites, puis allez parler à Sonia au labo. Elle vous demandera d'aller l'attendre sur le toit, accessible par la porte située en bas à droite de la pièce. Suivez les séquences, jusqu'à reprendre le contrôle de Geo, rentrez chez vous. Vous rencontrerez Bud et Zack avant de franchir votre porte, puis une nouvelle séquence aura lieu, apparaîtra bientôt Harp Note, la nouvelle FM-ienne qu'il vous faudra bientôt combattre. Dès que vous contrôlez à nouveau votre perso, dirigez-vous vers le Wavehole de " GDVague " afin de poursuivre Harp Note sur les ondes. Avancez donc jusqu'au troisième carré bleu (deux tout droit, puis un à droite), Mega vous dira de préparer votre stylet. Vous devrez tirer en pointant sur l'une des 4 directions afin de détruire les notes de musique qui vous foncent dessus. Une fois ceci effectué, vous gagnez 500 zennys et devez poursuivre par le bas, pour ensuite prendre à droite au prochain carré bleu et bientôt faire face à Sonia. Elle va disparaître et il vous faudra continuer sur le secteur suivant, en avançant jusqu'au quatrième carré/rectangle bleu, où vous serez encore attaqué par ces notes de musique. Réussissez pour poursuivre et pour empocher 700 zennys, puis poursuivez vers la gauche pour bientôt à nouveau faire face à Sonia. Elle s'échappe une fois de plus... Effectuez un " pulse-out " et rendez-vous alors à AMAKEN.
N'entrez pas dans le bâtiment, mais effectuez plutôt un " pulse-in " à droite de l'étoile qui se trouve non loin de l'entrée. Avancez jusqu'à un premier téléporteur, puis empruntez la route du bas (l'autre mène à un marchand) pour ensuite contourner par la gauche jusqu'au prochain carré bleu où vous serez une fois de plus attaqué par les notes. Réussissez l'épreuve et vous remporterez 1000 zennys en plus de la possibilité de continuer. Avancez, puis prenez à droite au prochain croisement, pour vous trouver face à Harp Note. Vous engagerez le combat après le dialogue.
Boss : Harp Note
Elle dispose de 700 HP et de trois attaques. L'une consiste à faire apparaître deux caissons de basse qui vous enverront une note si vous vous trouvez en face, mais vous aurez assez de temps pour vous protéger en vous décalant en face de Harp Note, vous laissant en plus l'opportunité de la frapper. Elle fera également vibrer ses cordes de temps à autre, mais seulement sur une colonne. Là aussi, ceci peut être facilement esquivé. Enfin, la dernière attaque touche toutes les cases sur lesquelles vous vous déplacez, donc tentez de la bloquer avec le bouclier ou vous serez non seulement blessé mais étourdi un court instant.
Suivez les séquences qui suivent votre victoire, et où vous ajouterez Sonia à votre liste de frères, vous permettant ainsi d'acquérir différentes capacités supplémentaires ainsi que 30 HP de plus à votre jauge maximum. Vous disposerez enfin d'une carte spéciale, vous permettant d'invoquer un pouvoir de Sonia. Elle vous quitte et vous rentrez chez vous...