Dans l'atelier, parlez à Big et acceptez de l'aider à retrouver Norton (une des quatre grenouilles disséminées dans Green Hill), ce que nous ferons un peu plus tard, puis sortez en ayant sélectionné Knuckles, Amy et Big dans votre équipe. En sortant, vous obtiendrez le détecteur Eggman, puis il vous faudra vous rendre au sud, en direction des ruines mystiques. Une séquence se déclenchera durant laquelle Shadow apparaîtra, et Tails conseillera alors de le suivre. Avant cela, sautez sur le bâtiment de droite et utilisez les capacités de Knuckles, puis d'Amy, pour rejoindre le sommet et récupérer les sandales d'alliage, ainsi qu'un oeuf supplémentaire. Rendez-vous ensuite au nord-ouest de la carte, juste à gauche du QG, afin d'utiliser la capacité de Knuckles qui vous permettra de passer derrière la façade et repérer ainsi un signal. Après avoir vaincu (ou non, car le combat n'est pas obligatoire selon votre réponse) le robot d'Eggman qui se trouve dans le coin gauche, vous empocherez l'appareil d'Eggman. Rendez-vous maintenant à gauche du magasin, afin de détecter un autre signal et d'entrer dans le bâtiment d'où il provient. Dites à l'homme qui se trouve à l'intérieur que vous acceptez de lui retrouver son agrafeuse et prenez ensuite la direction des ruines mystiques (en ayant de préférence échangé Amy avec Tails dans l'équipe à l'atelier), car nous nous occuperons plus tard de son cas.

Arrivé aux ruines, avancez jusqu'aux ventilateurs activés dans le chapitre précédent pour voir apparaître un signal, puis suivez la direction de l'étoile pour rencontrer Shadow. Sachez que si vous lui répondez " A moi l'honneur " durant la discussion, vous engagerez un combat contre lui. Il disposera de 225 PV et vous obtiendrez un autre appareil d'Eggman suite au combat. Toutefois, vous pourrez également récolter cet objet en évitant le combat et en lui disant que vous ne voulez pas vous battre avec lui. A vous de choisir donc. Suite à ceci, utilisez les ventilateurs avec Tails pour vous rendre dans la pièce où vous aviez trouvé Knuckles et y récupérer un oeuf. Une fois dehors, utilisez Big puis la roulade de Sonic pour vous rendre dans le bâtiment sud-est de la carte afin d'y trouver un oeuf et engager un combat contre des mille-pattes. En sortant, entrez dans la porte du bas après avoir ramassé un autre oeuf, puis vous ressortirez par la porte la plus au sud. Dirigez-vous alors sur la gauche pour affronter des guêpes géantes, ainsi qu'un ver colossale lorsque vous souhaiterez vous emparer du ring de gauche. Après avoir nettoyé le secteur, prenez la direction de votre avion pour détecter un autre signal (près de la statue située un peu plus au sud de l'appareil), puis affrontez donc ces Robotatous avant de suivre la route qui mène à l'étoile apparue sur la carte. Vous entrerez alors dans un bâtiment où vous aurez une fois de plus à faire à des Robotatous, grâce à qui vous pourrez récupérer un nouvel appareil d'Eggman. Vous pouvez maintenant rentrer à Central City (ou explorer encore un peu le nord-est des ruines mystiques pour d'autres oeufs) pour vous restaurer et prendre ensuite la direction de Green Hill.

De retour à Green Hill, montez sur la structure en pierre blanche de gauche grâce à Knuckles pour y récupérer un oeuf, puis parlez au personnage qui tourne en rond sur la droite de la carte (une étoile devrait vous indiquer son emplacement). Vous pourrez récupérer l'agrafeuse de l'homme situé dans le bâtiment à gauche du magasin de Central City. Ramenez-lui donc pour obtenir un nouvel appareil d'Eggman. Revenez à Green Hill, puis traversez le pont que vous aviez rabaissé en vous plaçant sur les interrupteurs. En avançant un peu plus au nord, vous capterez un signal. Un enfant appelle à l'aide et est pris au piège par des scorpions géants (225 PV chacun) dans la caverne située plus haut. Sauvegardez, puis allez donc relever ce challenge pour récolter un nouvel appareil d'Eggman.

Occupons-nous maintenant de la mission de Cream, cette lapine que nous avions rencontrée dans le chapitre précédent. Son Chao, Cheese, se trouve en réalité au sommet du temple situé au sud-est de cette grande île principale et ce sera grâce à Knuckles que vous pourrez y accéder. Une des quatre grenouilles relatives à la mission de Big acceptée en début de chapitre se trouvera à l'extrême sud-est (nous chercherons les 3 autres dans peu de temps). Une fois au sommet du temple, outre le fait de récupérer Cheese, vous pourrez trouver également un Gris-gris sacré. Le fait de ramener Cheese à Cream ajoutera cette dernière à l'équipe.

Le docteur Madden, rencontré également dans le chapitre précédent, nous avait donné lui aussi sa mission. Vous aurez besoin d'Amy, de Knuckles, de Tails (ou Rouge) et de Sonic pour mener à bien cette mission.

{{uppage}}Commencez par sauter sur le rocher en forme d'emprunte de patte, puis volez vers la droite. Grimpez ensuite avec Knuckles, brisez les caisses avec Amy, puis poursuivez avec Sonic. Vous trouverez bientôt la deuxième des 4 grenouilles en rapport à la mission de Big, puis un des émetteurs de Madden vous attendra au sommet de cette montagne, après avoir utilisé le tremplin. Un faucon rapace interviendra pour vous empêcher de désactiver le système. Suite au combat, rendez-vous donc au sud-ouest de la carte pour trouver un second émetteur. Comme précédemment, préparez-vous à affronter les faucons lorsque vous choisirez de désactiver le système. Allez donc trouver la troisième grenouille à droite de là où Cream vous attendait, en haut de la pente, sur le plan d'herbe de gauche, puis revenez à l'est de la carte pour utiliser le radeau qui vous avait mené ici au début de l'aventure. Montez au nord de l'île sur laquelle vous débarquerez pour trouver la dernière grenouille, Norton, puis vous récolterez une feuille de santé. Le troisième émetteur sera situé quant à lui à l'extrême nord-ouest de la carte, sur l'île la plus à gauche. Après avoir vaincu le faucon, rejoignez donc le docteur Madden pour obtenir notamment un spray de guérison.

Les 5 appareils en poche, rendez-vous au niveau de la pente ouest de la carte pour trouver l'entrée d'une caverne au sommet. Affrontez les drones laser, puis sauvegardez avant de combattre contre 3 rambots de 2ème génération très coriaces. Après les avoir vaincus, une discussion avec Eggman démarrera et le chapitre prendra fin.