Chaque Dark Note terminée dans le mode Chaos Shrine permet d'obtenir une nouvelle Dark Note dont le niveau de difficulté (le nombre qui suit la mention "N°") dépend du niveau actuel de votre équipe. Si vous voulez obtenir une grande diversité de Dark Notes, prenez une équipe assez faible. De cette manière, même si vous ne tuez pas les boss, vous débloquerez un grand nombre de Dark Notes à la difficulté progressive, chacune permettant d'obtenir des cristaux différents. De plus, si vous prenez dans votre équipe un personnage doté de la capacité Libra (comme Cid), des items de drop vous seront dévoilés sur chaque Dark Note que vous débloquerez (1 item pour Libra lvl1, 2 pour Libra lvl2, 3 pour Libra lvl3). Vous pourrez ensuite les refaire avec une équipe plus évoluée pour vaincre les boss afin de récupérer les cristaux, ce qui vous évitera de recommencer toujours les mêmes Dark Notes.

L'autre moyen d'obtenir des Dark Notes est d'échanger votre ProfiCard contre celle d'un autre joueur via le mode Streetpass en local. A chaque fois que vous attachez une nouvelle Dark Note à votre ProfiCard, vous devez réussir une Dark Note en mode Chaos Shrine avec un autre joueur pour pouvoir vous échanger vos deux Dark Notes.

Note 1 : Si tous vos personnages sont niveau 99, le niveau de la Dark Note que vous débloquerez sera aléatoire. Ce qui vous permet d'obtenir des Dark Notes plus faibles même lorsque tous vos personnages seront lvl 99.

Note 2 : Si vous avez supprimé votre Dark Note la plus récente, il vous suffit de refaire celle qui est située en haut de la liste pour en débloquer une nouvelle.