En arrivant, ramassez l'Enregistrement Audio au sol, Surchargez si vous le pouvez le conduit niveau 80 à gauche pour débloquer la porte au fond menant à une Injection vitale v5 protégée par deux Homo machinalis, puis traversez les passerelles. Activez l'interrupteur pour faire venir la Base d'Opérations à votre niveau, à l'intérieur de laquelle vous trouverez un Enregistrement Audio ainsi que Alec Norris si vous aviez entamé sa quête, puis traversez pour entrer dans la pièce en haut à gauche.

Derrière les caisses vous y attend un nouvel ennemi très dangereux, un soldat de nanites, qui sera capable de créer de l'armure sur ses parties vulnérables au fur et à mesure et dispose d'attaques très rapides et puissantes. Dans les escaliers qui suivent, vous devrez faire face à plusieurs soldats détraqués ainsi qu'à davantage d'Homo machinalis. Passez la porte à mi-chemin pour pouvoir sauter sur le toit de la base et récupérer un Désinhibiteur SNS v4, faites le tour pour terminer de monter et ramassez l'Enregistrement Audio au sol avant d'ouvrir la porte.

Vous voilà au Niveau 2 – Ravitaillement : éliminez le soldat nanite au fond à droite, faites le tour de ce côté pour appeler l'ascenseur et ainsi amener la Base d'Opérations à votre niveau, passez derrière le container éclairé sur la gauche pour défier deux soldats nanite et ramassez l'Enregistrement Audio et l'Injection vitale v5. Retournez faire le tour de la base, éliminez l'Homo machinalis embusqué à droite pour récupérer un Amplificateur d'endurance v5, disposez soigneusement du soldat nanite plus loin en contrebas ainsi que des deux soldats détraqués sur la gauche et passez la porte au fond.

En bas, détruisez les caisses sur la gauche après avoir occis l'ennemi pour récupérer une Electrocellule en vanadium v5. Éliminez l'autre soldat plus loin en vous méfiant des toxiques au sol, ouvrez la porte pour former un raccourci vers les escaliers et laissez-vous tomber par deux fois sur la gauche pour atteindre d'autres couloirs infestés de soldats détraqués. Empruntez l'Exo-élévateur au fond sur la gauche pour ramasser l'Injection vitale v5, redescendez et éliminez les deux soldats Hazard derrière la grille à droite en prenant garde au milieu toxique. Traversez rapidement le couloir plein de gaz qui suit et éliminez les deux soldats Hazard sur la gauche du conduit à Surcharger.

Empruntez la coursive où se trouvait l'un des soldats et déverrouillez la porte de sécurité au bout du couloir pour atteindre la Préparation d'Utopia classifiée. Un soldat nanite vous y attend de pied ferme, de même qu'un golem nanite, ennemi capable de déchaîner de courts enchaînements très puissants ou de se transformer en tourelle l'espace d'un instant : vous devrez le Surcharger lorsqu'il s'éparpille pour le vaincre. Il se trouve au fond à droite, et c'est aussi sur le terminal près de lui, où se trouve un Enregistrement Audio au sol, que vous pourrez utiliser la Puce chiffrée confiée par Chavez pour tenter d'enrayer Utopia. Sur le chariot près des escaliers en face de l'entrée, vous trouverez également le Comics IRONMAUS #23 ainsi qu'un autre Enregistrement Audio sur un terminal.

A l'étage, débarrassez-vous des deux Cerberus et du Gorgon, ramassez l'Enregistrement Audio au sol, Surchargez le conduit niveau 30 au fond du couloir de maintenance à droite et retournez au rez-de-chaussée de la pièce pour traverser le couloir au fond défendu par le golem. En empruntant le chemin rempli de nanites sur la gauche, vous atteignez le Pas de tir N°2 : vous y trouverez le long du chemin un Enregistrement Audio ainsi que l'arme Götterdämmerung sur l'avancée au bout. Rebroussez ensuite chemin jusqu'à la Station de pompage d'azote et empruntez cette fois l'Exo-élévateur au bout du couloir de droite.

Ramassez un Enregistrement Audio, éliminez les troncs d'Homo machinalis au sol plus loin et détruisez la grille au fond : de l'autre côté vous attend un golem nanite. Infligez-lui suffisamment de dégâts pour qu'il s'éparpille au sol et approchez-vous de lui pour le Surcharger et le détruire. Passez ensuite dans le couloir de maintenance sur la gauche pour aller ouvrir un raccourci, rebroussez chemin et ouvrez la porte de droite. Vous atteignez ainsi un couloir au bout duquel se trouvent un Enregistrement Audio sur un terminal ainsi qu'un ascenseur : vous pouvez également ouvrir la porte à droite pour créer un raccourci vers la Base d'Opérations.

En haut de l'ascenseur, éliminez le Cerberus et le mécha de sécurité, profitez de la Station infirmerie au mur avant de monter vers la gare et éliminez-y le Cerberus et le Gorgon. En empruntant le MagLev, vous retournerez à la Production centrale B, ce qui activera la Base d'Opérations locale comme checkpoint même si vous revenez au Nucleus. Récupérez quoi qu'il en soit le Régénérateur plasmique v5 derrière la grille au fond à droite et laissez-vous tomber dans le trou. Éliminez rapidement le drone qui protège le soldat nanite pour faciliter le combat, avancez dans le couloir et laissez-vous tomber au fond.

En contrebas se trouvent deux golems nanite, qu'il faudra bien sûr affronter séparément : laissez-vous donc tomber au plus près pour occire celui qui patrouille juste en dessous avant d'aller défier le second et Surchargez le conduit qu'il défendait. Cela aura pour effet de débloquer l'Exo-élévateur plus loin en bas des escaliers qui vous permettra de faire monter la Base d'Opérations jusqu'à vous. Passez ensuite la porte en bas desdits escaliers, éliminez le golem nanite dans la pièce à gauche et Surchargez le conduit dans la salle suivante : cela aura pour effet de détruire le mur de nanites qui vous bloquait au Niveau 1.

Empruntez ensuite les couloirs de maintenance derrière vous en y récupérant des matériaux, descendez via l'Exo-élévateur au fond, ramassez l'Enregistrement Audio au sol devant vous, rebroussez chemin et empruntez cette fois le couloir de droite pour pouvoir vous laisser tomber au Niveau 2 près de deux Homo machinalis. De là, il s'agira de redescendre vers le Niveau 1 avec quelques acrobaties pour pouvoir y ramener la Base d'Opérations. Ne vous restera ensuite plus qu'à traverser la zone désormais accessible où vous attendent deux golems nanite pour atteindre l'arène du boss final : tentez de Surcharger le conduit au fond pour déclencher le combat.

Victorieux, vous voilà libre de contempler l'épilogue... et de continuer l'aventure en Nouvelle Partie + !