Dans le hangar, dialoguez avec le docteur Carlyle, puis écoutez le speech de votre père. Après un bref voyage en navette (image 01), vous vous retrouvez rapidement (un peu trop) au sol, sur la planète. Lorsque vous aurez repris le contrôle du personnage, commencez par scanner les environs (images 02 et 03).
Pensez à le faire dans chaque zone que vous parcourrez afin d'engranger des Données de Recherche. Examinez le relais de communication à ansible pour voir qu'il est irréparable (image 04), puis reprenez votre avancée. Après quelques temps, vous arrivez sur une portion frappée régulièrement par la foudre (image 05).
Traversez-la en courant et en utilisant votre boost si besoin est. Quelques pas supplémentaires vous amèneront près d'une cellule de carburant (image 06). Scannez-la, puis tirez dessus pour étrenner votre arme. Reprenez votre avancée et ramassez les munitions (le ramassage se fait automatiquement) qui se trouvent sur le bord du chemin. Après une courte session de plateforme (image 07) vous permettant de vous familiariser avec le boost de votre combinaison, vous finissez par arriver en vue d'une structure alien émettant un rayon bleuâtre vers le ciel (image 08).
Après avoir admiré quelque temps la structure, vous découvrez Carlisle en bien fâcheuse posture. Le voilà acculé par deux aliens, et vous devrez choisir si vous respectez le protocole, ou bien si vous foncez dans le tas. Quelques soit votre choix, vous devrez les dégommer pour continuer. Après l'affrontement, scannez les corps des aliens, puis récupérez le fruit du combat (images 09 et 10).
Fouillez aussi les environs pour découvrir des ressources supplémentaires, et refaire le plein de munitions (image 11). Vous voilà maintenant face à un croisement. Partez à droite pour découvrir Kirkland en train de se faire malmener par des aliens. Descendez-les et allez inspecter le coprs de Kirkland pour découvrir qu'il n'a malheureusement pas survécu à l'affrontement (image 12). Prenez ensuite le temps de canner la structure extra-terrestre pour glaner quelques Données de Recherche supplémentaires (image 13).
A partir de là, vous pouvez explorer la zone afin de découvrir de nouveaux objets, et réaliser quelques missions secondaires, ou bien revenir auprès du vaisseau et emprunter le chemin de gauche pour continuer la mission principale. Progressez en suivant le chemin jusqu'à tomber sur une structure alien, et quelque ennemis que vous abattrez rapidement. Continuez à progresser ainsi de manière à tomber sur les restes de votre navette. Après avoir réglé leur compte aux quelques ennemis qui trainent dans le coin, et ramassé les quelques denrées disponibles dans les conteneurs, reprenez votre avancée. Dépassez une structure alien (image 14) et suivez le chemin afin d'arriver près d'un gouffre que vous allez devoir contourner (image 15).
Après cette petite balade de santé, vous arrivez sur le site du crash de la seconde navette, sous le feu ennemi (image 16). Eliminez la première vague, puis refaites le plein de munition avant qu'un vaisseau ennemi ne vienne amener des renforts (image 17). Tuez les deux vagues d'adversaires suivantes pour pouvoir continuer la mission. Après un appel du Pionnier, quittez la zone et revenez un tantinet sur vos pas pour découvrir un tas de cadavres aliens près d'une porte. Dépassez-la en longeant le mur pour découvrir un passage dans la falaise (image 18).
Grimpez à l'intérieur pour découvrir Alec Ryder qui vous attend. Après la cut scene, lancez vous à l'assaut du complexe alien en dégommant les ennemis jusqu'à atteindre le bâtiment (image 19).Progressez en prenant soin de visiter pour ramasser les différents conteneurs. Scannez aussi autant que vous le pouvez pour glaner quelques points de recherche supplémentaires. Au bout d'un moment, vous tomberez sur une gigantesque porte au pied du monolithe extra-terrestre (image 20).
Ryder devra, avec l'aide de SAM, déchiffrer un nouveau langage pendant que vous devrez contenir la menace adverse. Placez vos alliés en couverture sur chaque flanc, puis allez les aider lorsque les ennemis arriveront. Après avoir repoussé quelques vagues, allez rejoindre votre père près de la porte, et aidez-le à entrer (image 21).
Une nouvelle cut scene se déclenche, dépeignant des événements tragiques. Passez quelques scènes de dialogues pour en apprendre plus sur votre situation, puis assistez à la nouvelle cut scene. Vous voilà désormais arrivé au Nexus.