Dans Pokémon Masters, vous incarnez un jeune dresseur participant au grand tournoi de l'île de Passio. Bien qu'il s'agisse d'un grand tournoi de Pokémon, il n'y a aucune créature sauvage sur l'île, ce qui fait que chaque dresseur ne peut ramener qu'un seul Pokémon durant l'aventure.

Il existe cependant bien un moyen de changer de compagnon : l'évolution. Cette technique bien connue des fans de Pokémon permet de transformer notre créature en une version plus puissante. Elle est présente dans Pokémon Masters mais pas dans les premières heures de jeu. Voici comment l'obtenir :

• Tout d'abord il faut posséder un Pokémon susceptible d'évoluer. Pierre et son Tyrranocif par exemple, ne peuvent utiliser l'évolution.
• Entraînez votre dresseur et son Pokémon. Arrivé à un certain niveau (qui dépend du Pokémon, niveau 30 pour un starter comme Kaiminus).
• Rendez-vous dans le mode "Sync Pair Story", vous y trouverez des missions d'histoire à réaliser où vous accompagnez le dresseur choisi.
• Si le Pokémon choisi peut évoluer et que vous disposez des objets nécéssaires (obtenables assez facilement dans la boutique d'échanges), vous devrez alors réaliser un combat en 1V1.
• Venez à bout de votre opposant et votre Pokémon évoluera !

Notez qu'une évolution est définitive. Il n'est pas possible de retrouver l'ancien Pokémon par la suite.