Le plus frappant de ces changements est évidemment que le jeu quitte sa vue 3D et devient un side scroller. Cette nouvelle approche n'enlève pas les fondamentaux de la licence, puisque Olimar doit toujours explorer les niveaux en utilisant les Pikmins pour progresser et ces petites créatures possèdent toujours les mêmes capacités. Le Pikmin rouge est là pour s'occuper des flammes sur le chemin, le bleu est utile pour les phases aquatiques et le jaune peut être lancé pour atteindre des hautes plates formes.

Pikmin 3DS est attendu sur Nintendo 3DS pour 2017.