Disponible dès aujourd'hui en téléchargement sur l'eShop, Pokémon Shuffle est un puzzle-game dans lequel le joueur doit capturer des Pokémon sauvages en alignant des symboles à l'écran. Notez que le soft est disponible gratuitement dans son intégralité même s'il est possible d'acheter des joyaux avec de l'argent réel pour avancer plus rapidement dans les niveaux. D'autres fonctionnalités sont également accessibles via StreetPass.