La principale concerne l'ajout d'un mode 1 joueur, un plus non négligeable puisque la version originale faisait obligatoirement intervenir 2 à 4 Link contrôlés par des joueurs humains, contrairement à l'épisode GameCube qui autorisait le jeu solo. A l'instar de ce dernier, il sera donc possible de parcourir l'aventure tout seul en contrôlant deux Link en parallèle, un principe qui avait fait ses preuves sur GameCube. Par ailleurs, et là les fans seront encore plus aux anges, le soft inclura des niveaux inédits reprenant le rendu graphique du tout premier Zelda sur NES, mais aussi de Link's Awakening sur Gameboy et de A Link to the Past sur SNES. Toutes ces nouveautés sont illustrées sur cette vidéo de présentation du jeu. Rappelons que les possesseurs de 3DS pourront bien entendu télécharger le jeu, mais on ignore encore sa date de lancement sur le DSiWare européen.