Située entre La Revanche des Sith et Un nouvel espoir, l'intrigue du jeu s'articule autour de Cal Kestis, un padawan ayant survécu à l'ordre 66 qui a coûté la vie à de nombreux Jedi. Votre objectif est de terminer votre formation et de reformer l'Ordre des Jedi avant que les Inquisiteurs ne vous retrouvent.

Cette quête vous amènera à visiter des environnements divers et variés, qu'il s'agisse de forêts ancestrales ou de gigantesques bases impériales. Et préparez-vous à faire face à des ennemis redoutables, à l'aide de votre sabre laser, de vos talents pour l'esquive et la parade, et surtout de votre maîtrise de la Force !