Abstiens-toi d'aller trifouiller dans les fichiers système.
Copie le thème sur lequel tu te bases vers ~/.local/share/themes/
, renomme le (à la fois le dossier et dans le fichier index.theme) et modifie gtk-3.css ou un truc du genre. Je préviens quand même que le CSS des thèmes GTK+ 3 est extrêmement chiant à éditer et les fichiers font généralement plusieurs milliers de lignes