Ce que tu peux faire c'est enquêter sur un mystère en particulier, en essayant de reproduire les observations des Nomaï ou en te rendant à l'endroit mentionné dans les messages.
L'important ce n'est pas l'ordre dans lequel tu explore le système stellaire, mais ta compréhension de l'ordre des évènements passés. Relire régulièrement ton journal de bord permet souvent de connecter des choses entres-elles et progresser.
Comme le disent mes VDD, c'est inutile de recommencer car le jeu le fait déjà à la fin de chaque boucle. Par-contre je ne sais pas si tu es passé à côté ou non mais il y a un tuto sur Atrebois (village et musé).