Tu peux regarder ici : %LocalAppData%\FactoryGame\Saved\SaveGames
(trouvé sur google)
Le mieux est de mettre tes save à côté des tes save perso. Si tu as dû recréer un répertoire, c'est que tu n'es pas au bon endroit. Les sauvegardes de la version serveur et ta version local ne sont pas forcement sur la même arborescence.
De mémoire (pas sûr, je n'ai pas mon pc perso), je crois que depuis l'écran de chargement d'une save, tu as un bouton pour ouvrir directement le répertoire (j'espère ne pas confondre avec d'autres jeux)