Tant qu'à faire, autant poster la réponse.
Une solution simple consiste à utiliser la console et effectuer la commande "grow-pops" après avoir sélectionné la planète.
Cela rajoute des populations de notre espèce et la planète redevient accessible à nos troupes d'assaut.
D'après Peko? sur le forum Paradox Stellaris anglophone, on pourrait aussi utiliser la commande "own" suivi de l'ID de la planète, mais c'est un peu moins RP, j'ai pas essayé.