Je n'ai pas trouvé grand chose en dehors de ce topic sur le forum officiel.
https://forums.marvelheroes.com/discussion/74599/settings-reset-every-time-after-login
Je ne sais pas si la solution qui est proposée t'aidera, en gros ça dit de ne pas cocher lecture seule pour ton dossier Marvel Heroes Game dans Mes Documents, et de t'assurer que tu as le contrôle total (c'est dans l'onglet sécurité quand tu vas dans les propriétés du dossier).
Mais bon, ça n'a pas aidé l'auteur du topic en question, il a résout son problème en mettant la config par défaut.