Le DLC Extended Cut ajoute des cinématiques supplémentaire à la fin, l'ajout était peut-être là sans que tu t'en rend compte (si tu n'avais pas fini le jeu auparavant). Ca explique notamment ce qu'il se passe après pour les autres races, en fonction de tes choix.
Pour Citadelle, je ne sais plus à quel moment le DLC s'activent, il était peut-être trop tard, même si je crois me souvenir que c'est avant l'attaque de la base de Cerberus justement.