Tout est normale.
Pour le lieu d’apparition il suffit de ne pas activer la moindre fontaine, de relancer la partit, et on se retrouve à la dernière fontaine visité. La zone noir se n'est pas bien grave, mais on ne peut rien y faire. Après il n'y a aucune raison de revisité se que tu as déjà vu.
Pour les quêtes elle se remette à zéro mais se n'est pas la peine de les refaire, ton perso à quand même garder leur bénéfice. D'ailleurs, je ne sais pas si ça permet de re-récupéré l'expérience qu'elles donnent voir même des bonus puissants comme de nouveau point de compétence, mais si ça marche, raison de plus pour ne surtout pas les refaire, se serai de la triche.
Reprend ou tu en étais et continu comme si il ne s'était rien passer, la quête principale reviendra toute seule.
"Donc là vous me direz, attends de voir la fin du jeu pour lancer IT, ce que je comprendrais."
Non au contraire, vaut mieux tard que jamais.