J'ai actuellement trouvé une solution un petit peu dérivée à mon problème si ça intéresse quelqu'un.
Il s'agit de copier coller la totalité du répertoire du duke pour en garder un double et sauver tous les épisodes originaux. Sur l'autre copie, vous créez une map que vous nommez E1L1, écrasant ainsi l'ancienne map 1 de l'épisode 1. Ainsi, Lorsque, en jouant, vous ferez "new game / L.A maltedon", ça cherchera "E1L1" dans la liste de maps et ça trouvera donc la map que vous aurez créée. Vous pouvez alors mettre un duke bouton à la fin de la map créé, avec un lotag spéciale (je me souviens plus lequel). Soit vous ne faites rien et en jouant ça vous menera à la 2ème map habituelle du jeu, soit vous écrasez aussi la deuxième map. Vous pouvez faire suivre ainsi autant de maps que vous voulez, et achever l'épisode par un boss, qui y mettra automatiquement fin.