Tout d'abord je te conseil de logiquement commencer par le 1.
Donc :
1) Syrie et Israël dans le 1, la Turquie dans Revelations et les Caraïbes dans Black Flag.
2) Alors là... Florence et Venise (ACII) et Rome (Brotherhood) sont assez clean.
Mais l'une des qualités de la série est que les villes sont très vivantes, donc tu ne trouveras rien de complètement propre. N'hésites pas à préciser ce que tu entends par "sale". Parce que là...
3) Mis à part dans le 3 et Rogue les villes de tous les épisodes bénéficient de superbes monuments. Avec en tête (dans le désordre) le 2, Brotherhood et Unity.
4) Pour moi Altaïr (1 et Revelations) est le plus charismatique d'entre tous, de très loin. Mais cette question est sujette à débat. Pour certains c'est Ezio (2, Brotherhood et Revelations) par exemple, que je trouve moi assez lourd.
Et en ce qui concerne leurs qualité morales ils sont tous plus ou moins "justes" étant donné qu'ils sont forcés de suivre le crédo des Assassins (héros de Rogue mis à part).
5) Déjà tu ne peux pas nager dans le 1. Mais tu as des batailles navales dans le 3, Black Flag et Rogue. Et tu as donc Venise dans le 2.