Tout commence lorsque cinq hommes s'engagent et se rencontrent dans la Légion étrangère. Affectés à un programme de création d'organes, ils finissent par réussir à cloner un humain au prix de longues recherches. Chacun s'empresse alors de créer une réplique parfaite de lui-même. Mais le laboratoire secret est découvert et détruit et les cinq hommes se dispersent aux quatre coins du monde. Quatre d'entre eux retournent dans leur pays d'origine et deviennent des criminels notoires. Le dernier, le docteur Otto Wolfgang Ort-Meyer fait l'acquisition d'un asile en Roumanie. Si en apparence il est le seul à s'être rangé et à avoir renoncé à des activités louches, la réalité est tout autre.
Car en secret, Ort-Meyer poursuit le programme instauré par la Légion tandis que son asile lui sert de couverture. Il commence par installer son laboratoire dans le sous-sol du bâtiment et relance ses recherches. Ses expériences ne sont d'abord que des échecs mais il persévère. Jusqu'au jour où il trouve la bonne formule, en se basant sur son ADN et celle de ses quatre ex-collaborateurs. Il produit alors des clones à la chaîne, en essayant sans cesse de les améliorer. Finalement, il parvient à ralentir le vieillissement des cellules et dote ses clones d'une condition physique et d'une intelligence hors normes.
47 est issu de la série 4. Ort-Meyer le sort de sa chambre d'incubation le 5 septembre 1964, lui donnant ainsi la vie. Il constate rapidement qu'il a un énorme potentiel. 47 excelle durant sa formation de tueur et fait preuve d'une grande intelligence. Mais cela a un prix, le clone est différent, moins docile et plus renfermé que les autres. Il affiche aussi des sentiments en recueillant par exemple un lapin. Ce n'est que lorsque 47 a 25 ans qu'Ort-Meyer le considère comme mûr. Il décide alors de le libérer et se prépare à l'aider à s'évader du labo. La suite de l'histoire de 47 continue dès le début de Codename 47...