Encore une fois, les saisons se suivent et se ressemblent dans le royaume d'Hyrule. Bien que le jeune héros d'Ocarina of Time se retrouve plongé dans les événements de Majora's Mask (on le voit chercher sa jument Epona au début du jeu), rien ne vient perturber la paix du royaume. Le ranch Lon-Lon a d'ailleurs si bien prospéré qu'une ville s'est formée autour de lui. De capitale économique, la cité est devenue capitale politique avec même le déménagement du château. La pratique du bannissement des criminels est également devenue monnaie courante. Nombreux sont ceux qui ont suivi Ganon dans le Saint Royaume. C'est d'ailleurs de là que viennent les ennuis rencontrés dans Twilight Princess, l'épisode qui succède directement à Ocarina of Time/Majora's Mask.
Pour vous aider à passer d'un épisode à l'autre, prenez la carte d'Ocarina of Time (ci contre) et transportez le Château à la place du ranch. Tournez légèrement la carte dans le sens inverse des aiguilles d'une montre jusqu'à placer le village Cocorico à votre gauche. Comparez maintenant votre carte à celle de Twilight Princess, version Wii. La ressemblance est plus que frappante. Cocorico est toujours au pied de la montagne Goron, tout près se trouve la cascade Zora. Quant au désert et au lac, ils sont toujours côte à côte. La carte de Twilight Princess nous resservira d'ailleurs lorsque nous arriverons à Majora's Mask.
Excalibur permet aussi de faire la transition entre les deux épisodes. Durant tout ce temps l'épée est restée dans son sanctuaire du temple des bois perdus, dont l'entrée se situe au sud-est, une zone non cartographiée. Pourquoi donc ces bois ne nous mèneraient-ils pas vers des contrées oubliées au sud-ouest ? Ce serait en fait l'emplacement de l'ancien château et de son village (symbolisé par l'étoile jaune sur l'image). Un lieu depuis bien longtemps abandonné à en croire la végétation qui y règne désormais.
Entre Ocarina of Time et Twilight Princess, Ganon le banni n'a pas perdu son temps dans le royaume du crépuscule. Il a même réussi à y trouver la Triforce. Mais bloqué dans ce sombre royaume, elle ne lui est d'aucune utilité. Ganon use donc de persuasion sur Xanto, probablement en lui faisant miroiter la Triforce. Xanto renverse le gouvernement et parvient à faire sortir ses troupes pour les envoyer conquérir Hyrule. Zelda, incapable de contrer l'offensive, décide de livrer son royaume pour sauver la vie de son peuple.
C'était sans compter sur Midna, la princesse du royaume obscur, qui va utiliser le héros pour empêcher tout cela. Ensemble, ils y parviendront, jusqu'à ce que Ganon sorte lui aussi de sa prison. La Triforce est alors fragmentée : puissance, sagesse et courage reviennent à leur propriétaire respectif. La bataille finale est une nouvelle fois épique. Midna retourne dans son royaume et le miroir qui permettait le lien entre les deux mondes se brise, interdisant tout passage dans un sens comme dans l'autre.
Vaincu, Ganon meurt à genoux dans les plaines d'Hyrule. Du moins physiquement car on peut légitimement penser qu'un être aussi puissant que lui ne laissera pas disparaître aussi facilement son âme et son esprit, surtout qu'il est désormais libéré de sa prison. De plus, la Triforce est toujours fragmentée et il est fort possible que Ganon ait conservé son fragment de puissance afin de revenir d'entre les morts dans le prochain jeu : The Legend of Zelda !